1、短期停機
在完成一天工作以后，都要停機等第二天再繼續(xù)工作，則可按以下步驟停機。
A）關(guān)閉二次儀表（記錄儀、積分儀或色譜工作站）。
B）關(guān)閉檢測器電源（同時切斷柱箱溫度檢測器的電源）。
C）停止恒流泵工作，然后切斷其電源。
D）用二次蒸餾水沖洗進樣閥的進樣孔（在“LOAD”和“INJECT”兩個位置）。
E）切斷實驗室工作電源，加滿盛液瓶中的流動相，待第二天使用。
F）將儀器罩上防塵罩。
2、長期停機
液相色譜儀數(shù)周或數(shù)月暫不使用，這時除按《短期停機》的A）～D）步驟處理外，還須完成以下步驟：
A）拆下恒流泵的流動相盛液瓶，換上色譜柱指定的保護試劑（例：甲醇、去離子水等），開啟泵數(shù)分鐘（流速0.5mL/min~1.5mL/min）后停泵。
B）從系統(tǒng)中拆下色譜柱，用專用的密封螺帽將柱管兩端密封后保存。
C）用普通φ1.6導(dǎo)管替代分離柱聯(lián)結(jié)。
D）用二次蒸餾水或去離子水輸入輸液泵，開啟泵，流量1mL/min~2mL/min，沖洗泵體、進樣閥、檢測器流通池數(shù)分鐘，在沖洗過程切換六通閥數(shù)次，使定量管得到清洗。
E）拆除替代柱的導(dǎo)管、泵輸入端和出口的導(dǎo)管和流通池輸入、輸出口導(dǎo)管，分別用螺帽密封輸液泵出口和流通池輸入、輸出口。
F）撥下總電源接線板的插頭，貯存好專用的流動相和樣品，用干布擦洗儀器，罩上防塵罩。
G）檢測器存放地點應(yīng)干燥。
氣相色譜儀或液相色譜儀操作中，當(dāng)儀器的操作條件保持不變時，任一物質(zhì)的色譜峰總是在色譜圖上固定的位置出現(xiàn)，即有一定的保留值。又包含：死時間，保留時間，校下保留時間，保留體積等等。
在液相色譜儀中保留值定性的方法主要是用直接與已知標(biāo)準(zhǔn)物對照的方法。當(dāng)未知峰的保留值（t'R或V'R）與某一已知標(biāo)準(zhǔn)物完全相同時，則未知峰可能與此已知標(biāo)準(zhǔn)物是同一物質(zhì)，特別是在改變色譜柱或改變洗脫液的組成時，未知峰的保留值與已知標(biāo)準(zhǔn)物的保留值仍能完全相同，則可以基本上認(rèn)定未知峰與標(biāo)準(zhǔn)物是同一物質(zhì)。
在利用保留值數(shù)據(jù)進行比對和定性分析時要特別注意到：由于液相色譜柱的填柱技術(shù)較復(fù)雜，液相色譜儀所使用的色譜柱的重現(xiàn)性目前還很不理想，即使是同一批號的柱子，重現(xiàn)性也不一致，這就使得使用保留值數(shù)據(jù)進行分析受到限制。因此，目前保留值數(shù)據(jù)只能作為定性分析的參考?？梢愿鶕?jù)這些數(shù)據(jù)和對樣品的了解來選用已知標(biāo)準(zhǔn)物，再用這些已知標(biāo)準(zhǔn)物與未知物在同一色譜條件下直接進行對比。
比較簡單的保留值定性方法是將已知標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)加到樣品中去，若使某一峰增高，而且在改變色譜柱或洗脫液的組成后，仍能使這個峰增高，則可基本認(rèn)定這個峰所代表的組分與已知標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)為同一物質(zhì)。
目前一些液相色譜儀儀器配備了三維圖譜檢測器，如二極管陣列檢測器，在進行未知組分與已知標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)比對時，除了比較保留時間外，還可以比較兩個峰的立體圖形。如在使用二極管陣列檢測器時，除了比較未知組分與已知標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的保留時間外，還可比較兩者的紫外光譜圖，如果保留時間一樣，兩者的紫外光譜圖也完全一樣，則可基本上認(rèn)定兩者是同一物質(zhì)；若保留時間雖一樣，但兩者的紫外光譜圖有較大差別，則兩者不是同一物質(zhì)。這種利用三維圖譜比較對照的方法大大提高了保留值比較定性方法的準(zhǔn)確性。美國Bio-Rad公司的血藥分析儀（Remeeli）就是依靠三維圖譜的綜合數(shù)據(jù)的分析來鑒別未知藥物的。
液相色譜柱都是按照嚴(yán)格的標(biāo)準(zhǔn)生產(chǎn)和測試的，如能按照以下信息使用和維護色譜柱，不但能得到更佳的檢測結(jié)果，更能夠延長色譜柱的使用壽命。
色譜柱的安裝：
1、首先應(yīng)確認(rèn)柱和儀器的接頭以及管路是否匹配。為減少死體積，進樣閥、柱子、檢測器之間的連接管路內(nèi)徑盡可能使用內(nèi)徑較小的管線，同時控制進樣器、色譜柱和檢測器之間連接管線的長度。安裝色譜柱之前，確認(rèn)流路系統(tǒng)中的溶劑是否正常。對分析較復(fù)雜的樣品建議安裝保護柱。
2、為了使色譜柱與儀器系統(tǒng)達(dá)較佳的連接效果，應(yīng)盡量使用與色譜柱接口相匹配的螺帽和錐形接頭，如原來的接頭長期匹配其他類型的色譜柱，建議在連接新色譜柱前應(yīng)檢查匹配情況，避免造成色譜柱的損壞或因色譜柱不匹配造成的漏液。
3、使用PEEK材料的通用接頭，只需用手?jǐn)Q緊不需要特定扳手，使用壓力為5000psi；使用溫度不得超過100℃。
流動相平衡：
1、在進行樣品檢測前，至少使用20倍柱體積流動相使色譜柱充分平衡。流動相一定要使用色譜級別的溶劑。如使用水相的緩沖液應(yīng)當(dāng)天配制以保持新鮮避免細(xì)菌產(chǎn)生。
2、流動相使用前需用微孔濾膜過濾,消除流動相中顆粒對色譜系統(tǒng)和色譜柱的損壞。緩沖液與其他流動相混合后應(yīng)重新過濾避免溶解度變化造成產(chǎn)生新的沉淀。不應(yīng)使用純水作為流動相沖洗C18色譜柱，以免柱性能損壞（添加5％的有機溶劑沖洗色譜柱，同時可以達(dá)到對緩沖鹽清洗的作用。還可以使色譜柱更容易平衡）。
3、流動相需脫氣后使用，可避免因氣泡導(dǎo)致的泵和檢測器的工作不正常。如果測試時使用的流動相與色譜柱保存使用的流動相有較大區(qū)別，應(yīng)該使用過度分布的形式進行平衡。避免由于流動相的突然變化造成柱壓增加過大或流動相緩沖鹽結(jié)晶造成對色譜柱和儀器系統(tǒng)的損壞。正相色譜柱比反相色譜柱需要更長的平衡時間。
樣品制備與操作：
1、樣品應(yīng)當(dāng)盡可能溶解在能與流動相相互溶的溶劑中。除特殊指明外，如使用強溶劑溶解樣品柱子的分辨率將可能降低。
2、樣品溶液在進樣前應(yīng)使用針頭式過濾器對樣品預(yù)先過濾。頻繁改變流動相組成，會加速降低柱效。
3、色譜柱由高壓勻漿法裝填，能承受較高壓力。為獲得較佳分離效果，使用時請不要超過200kgf，而且避免壓力突然上升或變化，否則會造成硅膠填料的破壞，減少色譜柱的使用壽命。除特殊要求外最高操作溫度不要超過60℃。
保存色譜柱：
1、如果流動相含有酸或無機鹽，應(yīng)當(dāng)先用去離子水（20倍柱體積）沖洗干凈。然后用用100％乙腈或甲醇保存色譜柱。最后用柱子的接頭密封，并放在穩(wěn)定的環(huán)境中存放。
2、應(yīng)避免色譜柱受到直接的機械沖擊或摔落，避免造成色譜柱性能的降低。
色譜柱的再生：
1、用相當(dāng)于20倍柱體積的溶劑按下列順序沖洗柱子，建議按柱子的箭頭方向沖洗，盡可能不反沖：沖洗時使用的的參考溶劑順序是水、甲醇、氯仿、異丙醇、甲醇。
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