1、生物顯微鏡的安放應選擇干燥清潔的房間，以避免光學部件發(fā)霉、金屬部分生銹以及粘滿灰塵。顯微鏡使用完畢后，即放回箱(柜)內(nèi)，或用玻璃罩、塑料套罩住，并放入干操劑。
2、不要自行拆卸生物顯微鏡各部件；鏡筒要插上接目鏡或益上鐐苗蓋，避免灰塵從鏡筒上部進入；透鏡表面不要用手指碰觸或拭擦，如有灰塵，先用柔軟毛筆輕輕拂去，再用柔軟的清潔細布拭撩，也可用擦鏡紙蘸少許二甲苯或石油迷試擦，但注意不要在透鏡表面劃出條紋。如鏡片有輕度長霉，用擦繞紙擦不去時，可用棉簽蘸少許70%乙醇與30%乙迷混合液輕輕拭撩。
3、生物顯微鏡不可與腐蝕性酸類、減類或揮發(fā)性強的化學藥品放在一起，以免被腐蝕，縮短使用年限。原則上，當觀察含液體的標本時，一般都要蓋上蓋玻片；若液體中含有酸、堿等腐蝕性化學物質時，應把蓋玻片的四周用石蠟或凡士林封住，然后觀察。但由于進行中藥顯微鑒定時，經(jīng)常要用這一類試劑，不可能都封固，因此要特別小心，防止液體流到載物臺上，吏不要沾到物鏡上。
4、生物顯微鏡不應在直射陽光下暴曬，也不要放在靠近爐子或暖氣的地方，以避免過劇的冷熱變化引起透鏡和機件的脫膠、變形或損壞。
5、清潔接生物顯微鏡物鏡只限于外表面。接物面被藥品污染后即用撩鏡紙蘸少許擦鏡液拭擦(不要用乙醇)；若背面須清潔時，可用柔軟毛筆拂拭，或用皮吸頭吸去灰塵。
6、轉動粗細調比鋁調焦時，動作要緩慢，不要壓碎蓋被片，以防接物鏡和集光器受控擊而損壞。
7、使用油鏡后，須將鏡頭上的香柏油拭探干凈(可用擦鏡紙蘸少許二甲苯拭擦，但注怠二甲苯不能滲入鏡頭內(nèi)部，否則二甲苯溶解透鏡之間的粘合劑，可使鏡片脫落)。
8、反光鏡鏡面要保護清潔，不要使水、二甲苯或香柏油透入，以免反光鏡的水銀脫落。
9、加機械部分不靈活，可用細綢布蘸二甲苯少鈞：拭去銹和油膩(不得用乙醇，因為這些溶劑會侵蝕油漆)，再用少許液體石服潤滑；旋扭過緊不要強行扭動，以免損壞。
10、有時在生物顯微鏡的視野中發(fā)現(xiàn)有污點或異物，可先轉動目鏡，如果這些污點跟著旋轉，則可確定污點是在目鏡上；否則，可移動標本片，如污點跟著移動，則污點是在標本片上。如果兩者都不是，則污點是在物鏡上，可先撿食物鏡的前鏡頭，然后檢查后鏡頭。根據(jù)不問情況進行清潔處理。
有時視野的一部分不清晰，這可能是物鏡或目鏡的前透鏡表面有指印或灰塵，也可能是標本片做得不好或顯微鏡用法不當，如照明系統(tǒng)末調好等原因，應查明情況，分別解決。
11、生物顯微鏡用畢后，應將各部分擦拭干凈，格接物鏡轉成八字形，然后將鏡筒和集光器下降固定，再將反光鏡的鏡面置垂直的位置。
激光共聚焦顯微鏡是在熒光顯微鏡成像基礎上加裝了激光掃描裝置，利用計算機進行圖像處理，把光學成像的分辨率提高了30%--40%；
使用紫外或可見光激發(fā)熒光探針，從而得到細胞或組織內(nèi)部微細結構的熒光圖像，在亞細胞水平上觀察諸如Ca2+ 、PH值，膜電位等生理信號及細胞形態(tài)的變化；
成為形態(tài)學，分子生物學，神經(jīng)科學，藥理學，遺傳學等領域中新一代強有力的研究工具。
激光共聚焦成像系統(tǒng)能夠用于觀察各種染色、非染色和熒光標記的組織和細胞等，觀察研究組織切片，細胞活體的生長發(fā)育特征，研究測定細胞內(nèi)物質運輸和能量轉換。
能夠進行活體細胞中離子和PH值變化研究(RATIO)，神經(jīng)遞質研究，微分干涉及熒光的斷層掃描，多重熒光的斷層掃描及重疊；
熒光光譜分析熒光各項指標定量分析熒光樣品的時間延遲掃描及動態(tài)構件組織與細胞的三維動態(tài)結構構件，熒光共振能量的轉移的分析；
熒光原位雜交研究(FISH)，細胞骨架研究，基因定位研究，原位實時PCR產(chǎn)物分析，熒光漂白恢復研究(FRAP)；
胞間通訊研究，蛋白質間研究，膜電位與膜流動性等研究，完成圖像分析和三維重建等分析。
基本原理
傳統(tǒng)的光學顯微鏡使用的是場光源，標本上每一點的圖像都會受到鄰近點的衍射或散射光的干擾；
激光共聚焦顯微鏡利用激光束經(jīng)照明針孔形成點光源對標本內(nèi)焦平面的每一點掃描，標本上的被照射點；
在探測針孔處成像，由探測針孔后的光點倍增管(PMT)或冷電耦器件(cCCD)逐點或逐線接收，迅速在計算機監(jiān)視器屏幕上形成熒光圖像。
照明針孔與探測針孔相對于物鏡焦平面是共軛的，焦平面上的點同時聚焦于照明針孔和發(fā)射針孔，焦平面以外的點不會在探測針孔處成像；
這樣得到的共聚焦圖像是標本的光學橫斷面，克服了普通顯微鏡圖像模糊的缺點。
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