如國家超級計算深圳中心主任馮圣中所言：“科學(xué)阻擊疫情的每個環(huán)節(jié)，都需要超算來支撐?！?/span>
3月3日，英特爾、聯(lián)想及華大基因宣布正攜手加快COVID-19新型冠狀病毒的基因組特性分析。通過這項(xiàng)合作，華大基因?qū)⒌靡岳^續(xù)優(yōu)化其新型冠狀病毒檢測試劑盒并獲取大量有價值的信息，有助于確定開發(fā)有效疫苗或治療方法的潛在靶標(biāo)。
聯(lián)想集團(tuán)高級副總裁、企業(yè)科技集團(tuán)總裁童夫堯說：“來自英特爾及聯(lián)想的大數(shù)據(jù)分析和健康與生命科學(xué)方面的專家，將整合我們的資源及專業(yè)技術(shù)，幫助解決目前面臨的嚴(yán)峻挑戰(zhàn)，推動健康和生命科學(xué)的發(fā)展進(jìn)程。”
在英特爾和聯(lián)想為華大基因提供的包括硬件、軟件、交付及服務(wù)的端到端解決方案中，大型高性能計算(HPC)集群用于處理從華大DNBSEQ-T7 測序系統(tǒng)讀取的高通量數(shù)據(jù)，支持科學(xué)家研究病毒的毒性、傳播模式、病原體與宿主間的相互作用，進(jìn)而助力流行病學(xué)及疫苗設(shè)計研究。這些工作對未來創(chuàng)建更好的診斷方法和設(shè)計有效的疫苗或其他保護(hù)性措施(例如免疫療法)至關(guān)重要。
在軟件方面，通過英特爾和聯(lián)想的共同努力，聯(lián)想超算技術(shù)支持并優(yōu)化的“基因組優(yōu)化和可擴(kuò)展性工具”(GOAST，獲得英特爾精選解決方案驗(yàn)證的基因組分析工具)，可為全基因組測序和全外顯子測序的計算提供高達(dá)40倍的加速，幫助華大基因更快生成可靠的基因組分析成果，縮短科研和臨床觀察的時間。
英特爾公司市場營銷集團(tuán)副總裁兼中國區(qū)總經(jīng)理王銳說：“華大基因通過分析病毒基因組數(shù)據(jù)，加速對感染者的快速識別和基因組特性的研究需要投入巨大的計算資源，這恰恰是我們可以發(fā)揮作用的地方?！?/span>
在基因測序工作中，每毫升體液通常包含數(shù)百萬個不同的病毒體，而每個病毒體的基因組則包含大約30000個DNA堿基或字母。華大基因目前對感染患者和疑似感染患者的微生物基因測序研究工作將生成TB級乃至PB級的海量數(shù)據(jù)。
“華大基因已對數(shù)百份臨床樣本進(jìn)行了測序，以分析和區(qū)分感染的并發(fā)癥?！比A大基因首席信息官晉向前說，“基因組比對、基因組組裝、基因組注釋和病毒核酸片段的系統(tǒng)分析，是一個高密度的計算過程，使用新的高性能計算和基因組分析技術(shù)是提高分析效率的重要因素。這些設(shè)備和技術(shù)將加快對新型冠狀病毒感染者的快速識別和病毒基因組特性的研究，為新型冠狀病毒的精準(zhǔn)診斷、治療和疫情防控提供強(qiáng)有力的支持?！?/span>
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